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琅琊英雄榜之:6mA的前身今世

2015-12-16

琅琊榜.jpg


DNA甲基化修饰只有5mC???

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6mA.jpg



靖王
苏先生,可知天下哪家能做6mA测序?
琅琊榜首之安诺基因。江左盟有句传言:表观产品哪家强,北京亦庄找安诺~~
梅长苏


1
6mA的起源

近年来全球科学家都将目光转移到研究表观遗传学上,表观遗传学主要研究内容之一的DNA甲基化修饰以多种修饰方式广泛存在于多种生物的基因组中,其中5mC和6mA是主要的DNA甲基化修饰。5mC在多细胞真核生物中的功能已有深入研究,但是6mA在真核生物基因组中由于其含量极低,因此鲜见研究。


2
6mA的分布

今年3篇Cell文章研究发现6mA存在于果蝇、衣藻和线虫基因组中,研究发现6mA主要富集在转录位点(TSS)附近,6mA的分布类似于CpG的ApT模式,甲基化主要发生在ApT双碱基中的A碱基中。至此6mA在真核生物基因组的分布及其调控机制吸引了全球许多研究者的关注。


3
6mA的检测方法

腺嘌呤甲基化6mA的检测需要新的超敏技术。这些技术的发展有助于我们理解真核生物DNA甲基化修饰情况。现有的6mA检测方法主要有:UHPLC-MRM-MS/MS、6mA-IPseq、6mA-REseq、SMRT。


6mA检测.jpg


其中6mA-IPseq、6mA-REseq是基于NGS的检测6mA方法,应用范围更广。


6mA-IP-Seq是一种类似MeDIP的基于免疫共沉淀的测序技术,采用6mA抗体特异的富集含6mA的片段,含蛋白酶A的磁珠调取DNA-6mA抗体复合物,洗脱富集的DNA-6mA片段后,乙醇沉淀DNA-6mA片段,PCR扩增得到6mA文库。


6mA-RE-Seq是一种基于酶切检测6mA的技术,采用对6mA敏感的内切酶消化DNA,若酶切位点中A为甲基化状态,则此位点不被酶切,未甲基化的A位点被切开。因此,6mA-RE-Seq测序技术在单碱基水平检测腺嘌呤的甲基化水平。


4
安诺产品

目前,安诺基因已能提供6mA-RE-seq、6mA-IP-seq两种检测6mA的测序技术,并且技术流程正在不断优化中,旨在为您提供全面领先的6mA研究方案。


5
参考文献

[1] Heyn H, Esteller M. An Adenine Code for DNA: A Second Life for N6-Methyladenine[J]. Cell, 2015, 161(4):710–713.

[2] Ye F, Luo G Z, Kai C, et al. N 6 -Methyldeoxyadenosine Marks Active Transcription Start Sites in Chlamydomonas[J]. Cell, 2015, 161(4):879–892.

[3] Zhang G, Hua H, Di L, et al. N6-Methyladenine DNA Modification in Drosophila[J]. Cell, 2015, 161(4):893–906.


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