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安诺基因生物信息学暑期培训班报名啦!

2015-06-15

       安诺基因生物信息学培训班已在全国各地举办三期,受到广大师生的好评。为更加系统的普及生物信息学知识,以满足科研工作者的需要,安诺基因现推出生物信息学暑期培训班,由安诺优达总裁陈重建博士为代表的生物信息学专家开发与讲授。即日起正式开放报名,限额50人,预定从速!


       时间:2015年7月20日-24日(共五天)

       地点:北京市经济技术开发区科创六街生物医药园88号院B2栋 安诺优达总部



讲师信息



1. 陈重建 博士

安诺优达总裁,中山大学和法国巴黎十一大学双博士,曾供职于法国居里国家研究院,在基因组学和生物信息分析领域有着极为丰富的研究经验,发表国际顶级期刊学术论文十余篇,荣获“北京市海外高层次人才”、“北京市特聘专家”。


2. 刘涛 博士

安诺优达RNA产品信息分析总监,具有五年生物信息分析工作经验,参与法国居里研究所单细胞转录组等项目。

3. 侯光远 博士

安诺优达DNA产品信息分析主管,负责外显子组测序、基因组重测序和单细胞重测序等生物信息分析及流程的开发。


课程安排


Linux系统介绍

系统介绍,历史介绍,优缺点介绍,cygwin的介绍;权限与目彔配置chgrp, chown,chmod等;vim编辑器,档案查阅:cat less等, 指令搜索 :which,df,du等;处理文本的常用方法。


常用生物信息分析软件

过滤软件:cutadapt,fastqc;比对软件:BWA,Tophat,Bowtie; 比对统计软件:samtools;变异检测软件:GATK,varscan;组装软件:velvet,cufflink;基因组注释软件:ANNOVAR;基因组浏览器:IGV;网络图分析软件:Cytoscape;功能注释软件:blastgo; miRNA鉴定软件:miRDeep2; Peaks搜寻软件:MACS;Motif预测软件:MEME。


perl语言

perl发展史,基本数据类型定义与使用;哈希与数组等;模式匹配与字符串处理等;bioperl的讲解;表格数据的常用处理;简单的序列查找;用perl画circos,用perl确定组装共线性。


R语言

R使用介绍,R数据结构介绍,R基础命令讲解;柱状图,折线图,散点图等;热图,维恩图,密度图等;泊松分布,负二项分布等;T检验,Person相关性检验等。


常用生物数据库使用

序列数据库:NCBI,UCSC,Ensemble等;功能数据库:KEGG,GO,DAVID介绍;其他数据库:GEO,SRA, uniprot等

1. 使用tophat和cufflink进行差异表达分析,2. DNA 组装评估方法讲解;3. 实际操作;4. 问题答疑;5. 需求建议。


培训费用


♦ 培训费:3500元/人,包含学费、讲义费、上机实操费用,以及培训期间午餐费用;

♦ 如学员参加培训后与安诺优达进行项目合作,则培训费可全额抵扣对应费用的项目经费;

♦ 安诺优达负责安排学员住宿,费用请各位学员自理;

♦ 学员可选择电子汇款,或现场付费,报名以收到培训费为准。


报名方式


请联系当地销售或下载附件安诺基因生物信息学暑期培训班报名回执表.docx填好后发送E-mail至training@genome.cn。

咨询电话:010-56315326-8020。



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