安诺生信大讲堂-肿瘤免疫治疗,靶向药物分析全面解读
2018.07.24

癌症发病率近几年来一直居高不下,“致癌”“防癌”“抗癌”等词汇,随时刺激着人们敏感的神经。虽然癌症是可以预防和控制的,但大家依然谈“癌”色变。癌症的治疗方法经历了从外科手术、激素治疗、放疗、化疗到现在比较火热的免疫治疗和靶向药物治疗。随着分子诊断技术的不断发展,癌症的治疗已经进入精准医学时代,主要包括靶向药物治疗,免疫治疗等,基因检测技术在其中起着举足轻重的作用。

靶向药物治疗

靶向药物是针对特定基因突变靶点设计的药物,可以特异阻断癌症通路,达到治疗癌症的目的。特定的基因突变靶点包括影响蛋白质功能的点突变、导致基因融合的结构变异以及引起基因剂量加倍的拷贝数变异。基于鉴定获得的基因突变靶点信息,可以匹配靶向药物使用信息。


化疗药物代谢分析

化疗药物代谢分析是指从正常组织或者血液中的突变进行代谢说明,从化疗药物的毒性、有效性两个维度进行评估。所谓胚系突变,即从生下来就带有的,属于个人属性,决定了对药物的敏感性、毒性的耐受性。需要通过基因检测找出相应的突变,从而检测患者对药物的耐药性。


免疫治疗评估

免疫治疗主要分为三种治疗方式:免疫检查点抑制剂、过继性细胞免疫治疗、肿瘤疫苗。


1.免疫检查点抑制剂

免疫检查点是存在于人体免疫细胞T细胞中的一类蛋白(例如PD-1),当T细胞遇到PD-L1时,会抑制T细胞的活力,从而避免杀死人体内的正常细胞。然而癌症细胞是由正常细胞突变发展而来,保留着可以抑制T细胞的属性,抑制剂可以在癌细胞“握手”之前,把PD-1抑制住,从而增强T细胞的攻击性,抑制肿瘤。可以用基因检测的手段来判断患者是否适合用这些药物。


2.过继性细胞免疫治疗

通过基因组测序检测突变,通过突变预测出新生突变抗原(携带有突变的一些蛋白的碎片),在体外将有突变的序列进行合成,在体外模拟“训练”患者T细胞,让T细胞对于新生抗原较敏感,将“训练”后T细胞打回入患者体内,在体内遇到新生抗原便会被激活,从而达到治疗肿瘤的作用。


图1 过继性细胞免疫治疗过程
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图1 过继性细胞免疫治疗过程



3.肿瘤疫苗

和细胞免疫治疗类似,通过正常组织DNA和肿瘤组织DNA测序检测出突变,从而预测出新生抗原,把新生抗原做成疫苗,从而诱导T细胞产生特异性的反应去攻击肿瘤细胞。


图2 肿瘤疫苗免疫过程
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图2 肿瘤疫苗免疫过程



由于基因检测指导的精准治疗出现异病同治、同病异治。靶向治疗受限于肿瘤异质性与高突变性,易出现耐药。化疗药物治疗产生的副作用较大。因此免疫治疗显现出它的优势。

但未经基因检测筛选的患者,其免疫治疗效率仅为20%左右。药物种类较多,因此需要对患者的基因组进行检测,从而判断患者适合用哪类药,需要进行适用性检测。此外,癌症治疗可能会带来癌症超进展,因此需要进行风险性检测。


那么如何通过基因检测的手段来进行辅助免疫性治疗呢?肿瘤免疫药物的有效率在特定人群中较高,比如发生错配修复基因非同义突变(引起蛋白质结构和功能发生变化的突变),微卫星不稳定,POLE基因缺陷,肿瘤突变负荷(TMB)高等。因此可以检测TMB、POLE基因突变等来判断患者是否适合免疫药物的治疗。TMB被定义为每百万碱基中被检测出的,体细胞基因编码错误、碱基替换、基因插入或缺失错误的总数。患者在决定是否要进行免疫治疗时可以检测TMB的含量,新生抗原负载高,频率高,把有突变的碎片呈递到细胞表面,和正常细胞差异大,更易引起T细胞的反应并进行攻击,因此越适用于免疫治疗。

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交流信息

交流主题:癌症研究前沿分享

交流内容:靶向药物匹配;化疗药物代谢分析;免疫治疗评估

(以上并非全部分享内容,获取更多干货请参与当日交流分享。)

交流时间: 2018年7月25日,15:00-16:00

交流平台:安诺基因生物信息交流1群(213357902)及2群(475638865)同时进行

交流形式:视频/语音实时交流

主持人:人基因组产品经理蔡可

主讲人:肿瘤高级信息分析工程师

注:

1)进群时请务必备注姓名及工作单位。

2)您可以在评论里留下您感兴趣的问题,我们将对问题进行整理,在线交流的过程中主讲人将为您详细解答。


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1.基于靶点突变,匹配靶向药物使用信息

2.基于SNP位点基因型,匹配靶向药物与化疗药物代谢特征

3.基于癌症基因组特征,分析免疫治疗的适用性与风险性

4.基于胚系突变,筛查癌症遗传风险

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参考文献

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