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安诺Hi-C助力千种昆虫基因组计划

2018-04-25

昆虫是世界上最繁盛的动物,没有之一,目前已发现100多万种,占所有生物种类逾50%,如此庞大的种类和数量决定了其在生物圈中扮演着非常重要的角色。为了促进我国昆虫研究的开展,加强国内外昆虫基因组学领域学者和科研工作者的交流与合作,2018年4月22日,中国农业科学院深圳农业基因研究组所联合浙江大学、西南大学等单位,在2018昆虫基因组与绿色防控大会上,共同推出“TOP1000昆虫基因组计划”。安诺基因作为千种昆虫基因组计划的合作方,将协助完成基因组测序及组装等工作

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Hi-C辅助基因组组装

昆虫基因组一般具备高杂合的特点,组装容易出现冗余且染色体构建困难。Hi-C技术揭示了染色质片段间的交互强度随距离衰减的规律,基于这一规律,Hi-C技术能够辅助基因组组装。近年来Hi-C在染色体挂载中的应用越来越广泛,依靠Hi-C辅助组装构建的基因组图谱无一例外均达到了染色体水平。

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Hi-C在染色体挂载中的应用

安诺基因作为国际领先的测序技术服务商,拥有雄厚的Hi-C技术实力和丰富的基因组项目经验,受邀做了题为“scafford到染色体的基因组组装方案”的报告。针对昆虫基因组高杂合,组装容易出现冗余且染色体构建困难的情况,安诺基因介绍了二代测序+三代单分子测序+Hi-C的方案,针对性解决上述问题。二代+三代单分子测序的方法在保证了准确性的前提下,能够更好的跨越杂合与重复区域,实现高质量高连续性组装。结合Hi-C技术,可以在较低成本较短周期内实现染色体组装。

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安诺Hi-C技术优势

01. 稳定的Hi-C建库体系

能够保证获得高质量的Hi-C文库。

02. 自主研发的流程

拥有具有自主知识产权的Hi-C纠错流程及迭代组装流程,目前已经在部分高杂合、高重复物种上取得了理想的组装效果,可以实现95%以上的染色体挂载率,而且可以发现组装的错误,去除冗余序列甚至实现单体型的组装,提升基因组质量。

03. 丰富的项目经验

拥有多种动植物基因组Hi-C辅助组装的项目经验。


借助强大的Hi-C技术优势,安诺希望为昆虫基因组学的发展与进步贡献自己的力量,助力TOP1000昆虫基因组计划的圆满完成~


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