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2017-12-12

lncRNA

lncRNA作为近两年研究的热点,在基因表达调控、物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等过程中均具有重要作用。2017年国内lncRNA相关基金项目421个,总资助金额为1.77亿


如此热点,怎能错过!双十二还在剁手吗?这次不用喽,科研小伙伴的福利来啦,小编整合lncRNA特征、作用机制、研究进展以及整体研究思路等多个层面,汇总而成lncRNA研究手册,一册在手,科研无忧~


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lncRNA简介


1lncRNA定义及特征


lncRNA是一类长度超过200nt的RNA分子,部分含有polyA尾巴以及启动子结构。一般无编码潜能,但最新研究表明部分lncRNA可编码一些多肽。lncRNA相对表达水平低,并且具有更强的组织及时空的特异性,但功能相对保守。


2lncRNA功能及作用模式


作为左右逢源的RNA分子,lncRNA可通过与DNA、RNA以及蛋白结合,在表观遗传、转录及转录后水平上等多种水平调控基因表达。


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图1 lncRNA作用模式


3lncRNA应用


随着非编码RNA研究的不断深入,lncRNA 在医学基础研究、疾病致病机制以及动植物研究领域的应用越来越广泛。


医学方向,特异性lncRNA可作为疾病诊断及预后的biomarker,并在疾病分子机制研究、靶向药物开发、致病机理等方面发挥关键作用。动植物研究方向相对滞后,但研究表明lncRNA可参与动物骨骼肌发育、胚胎发育等方面,可有效改善家畜生长发育,为畜牧业生产获得更大的经济效益;lncRNA在植物生长、分化及营养代谢、环境胁迫等多种生物过程中起着调节因子的作用。


4lncRNA研究进展


近年来,随着高通量测序技术的普及,大量lncRNA被鉴定发现,多样化的调控方式被揭示,lncRNA逐渐成为当前的研究热点。

 

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图2 2008-2017lncRNA文章数量汇总图


注:2014-2017年lncRNA数据大爆发,引发lncRNA研究热潮 。

 

lncRNA整体研究思路


基于lncRNA 多样化的作用方式,在动植物生长发育、环境胁迫及疾病研究等方面的应用越来越广泛。从文章整体研究思路进行分析,可分为特异性RNA分子鉴定筛选,及结合分子功能试验、ceRNA分析等方法进行深层次调控机制探究。


对于前者文章侧重于整合多种分析结果来进行关键特异性lncRNA分子,参考研究思路如下:


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图3  特异性lncRNA分子鉴定分析


筛选获得关键候选lncRNA后,为更深层次揭示其调控机制,需结合多种层面的实验手段进行验证,对lncRNA上下游调控机制,调控方式等进行深度研究。同样,根据调控作用及分子机制揭示的程度,文章水平上也会有更大的提升。


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图4  lncRNA分子机制研究思路


 lncRNA常用数据库


目前,lncRNA相关注释信息不断完善,不同数据库侧重点上有所差别,为更好地有效利用数据资源,小编整合了常见的lncRNA数据库,以便于有针对性的进行查询~


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安诺基因lncRNA测序拥有丰富的项目经验,全面的分析内容(多组学联合+ceRNA分析),更综合下游合作公司资源,涵盖 lncRNA筛选、分子生物学鉴定、直接靶点筛查、生物学功能研究、lncRNA-蛋白-DNA/lncRNA-RNA等多项功能验证研究,为您提供全面的一站式服务!



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