新增PacBio Sequel IIe!安诺优达全力打造亚洲超一流三代测序服务中心!
2021.04.20

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继2019年引进7台PacBio Sequel II测序平台后,为了满足市场需求,给客户带来更好更便捷的服务,安诺优达再次引进PacBio公司的最新Sequel IIe测序平台加速亚洲一流三代测序服务中心的建设。此举将进一步提升安诺优达在全球范围的大规模三代测序服务能力,为客户带来更短的服务周期和更好的测序体验。当前,安诺优达已拥有PacBio公司的Sequel IIe、Sequel II和Sequel三代测序平台,可满足广大科研用户的不同测序需求,能为客户提供全面且优质的服务!

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PacBio 的Sequel IIe测序仪相比之前的 SequelII测序仪在测序原理上并无差别,但是在以下方面,Sequel IIe测序仪进行了一些改进和优化:

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升级硬件和软件支持测仪器直接进行CCS处理,直接供客户使用HiFi reads进行后续分析。降低了工作流程的复杂性、完成结果的时间和整个系统的成本。

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提供包含HiFi reads的reads.bam格式文件,比subreads.bam文件更精简,包含3类reads:QV≥20的HiFi reads、其他低质量的CCS reads、其他reads包括单次读取或不满足最低CCS要求的reads。

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图1 三类reads的长度分布图

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HiFi reads生成与测序数据收集并行,最大程度缩短总体运行时间。在前一次Run的数据分析进行时,可以启动新的Run。生成30G的HiFi数据,CCS分析时间一般为8h左右。

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图2 测序数据收集和数据处理过程可并行进行

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Read population可视化优化后可看到reads在长度和准确度上的空间分布情况,以及subread passes数对最终reads质量的影响情况。

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图3 不同Passes数下各类reads的数量分布

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全新配套升级的SOFTWARE v10.0包含基因组组装、全长扩增子和Iso-seq等多款更新的分析流程:20X人基因组组装只需5.5h。

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所需的计算资源和存储资源更少,节省计算成本和存储成本。

总体来说,Sequel IIe测序系统的主要优势有以下几点:


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图4 人类基因组测序的总体成本比较

(左图为计算和存储资源比较,右图为耗材成本比较)


与传统的二代测序技术相比,三代PacBio测序技术具有超长读长、无需扩增、无GC偏好性、可以直接检测碱基修饰等优点,安诺基因从2019年引入三代测序仪Sequel II以来,在三代测序领域已拥有大量项目经验及成功案例,在动植物基因组De novo测序、全长转录组测序、真菌细菌基因组测序、三代宏基因组测序、人重测序、动植物重测序、微生物全长扩增子方向拥有较丰富的项目经验。此次再次引入Sequel IIe平台将更好地服务于用户,为用户提供更加全面,更加快速,更具性价比的服务与选择。




作为国内基因组行业知名企业,安诺基因拥有实力强大的测序服务平台,配备系列先进仪器设备,三代PacBio(7台Sequel II+1台Sequel IIe)为您的科研之路保驾护航;专业的生物信息分析团队,丰富的项目分析经验,让您的数据分析之途无忧。安诺基因已与中国农业大学、中科院遗传与发育所、中国海洋大学、中国农业科学院、福建农林大学等多家科研院所开展了深度合作,助力基因组文章发表于Nature、Nature Plants、Nature Communications、Molecular Plant、Communications Biology、The Plant Journal等多个国际高水平期刊。