实力展示-安诺空间转录组实测数据来啦~
2022.04.12

近几年,空间组学(Spatial omics)的热度与日俱增。相较于传统单细胞测序,空间转录组技术可同时获得时间和空间维度上细胞的基因表达模式和细胞类群空间位置信息,对于肿瘤疾病、生殖生育、神经生物学等领域的精细研究至关重要。其中主流代表是基于sequencing方法的10x Visium 空转技术,其不仅可以用于新鲜(冷冻)原位组织(FF样本)研究,也可以使用已存档的石蜡包埋样本(FFPE样本)进行回顾性研究和纵向研究,以挖掘生物标记和追踪特定时间内的生物学过程。



由于该技术的独特优势,研究者们可以更加深刻地理解正常发育过程和疾病病理。安诺优达对该技术进行了FF和FFPE不同类型样本的测试及优化,以下是部分项目经验的展示,跟着小编一起看看吧!


实测数据展示


新鲜组织基因检出中位数可达5000以上/spot,FFPE样本可达6800以上/spot。

高于官方测试数据(以人脑为例),并且样本间可重复性较强。


表1 安诺基因部分样本测试数据结果


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新鲜样本


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图1a 人肝脏样本


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图1b 人脑样本


石蜡包埋样本


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图1c 人脑样本


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图1d 人肺样本


表2a 新鲜样本(标红为安诺新增自测样本)

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表2b 石蜡包埋样本

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安诺空间转录组研究思路



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图2 空间转录组分析思路


除了常规的标准分析外,安诺还可进行轨迹分析、细胞通讯分析、空间转录组与单细胞转录组联合分析等,所以你的样本准备好了吗,快来和安诺来一场“10X空转”的约会吧!



安诺基因作为单细胞测序技术国内早期服务提供商之一,从传统单细胞测序到10x Genomics高通量单细胞测序;从单细胞转录组学至基因、表观、蛋白质的多组学平台;从常规转录组测序到空间转录组测序,涵盖三大组学,九大单细胞产品。为您的单细胞科研之路扫平障碍。