长链非编码RNA（long non-coding RNA）是一类长度大于200bp，不编码蛋白的RNA，广泛存在于生物体内。安诺基因lncRNA测序可选择采用去除rRNA或DSN真核生物全转录组建库的方法进行文库构建，利用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的lncRNA序列信息，依托强大的生物信息分析平台，鉴定已知lncRNA，并预测新的lncRNA及其靶标。

全基因组范围内鉴定水稻生殖发育相关的长链非编码RNA

Genome-wide screening and functional analysis identify a large number of long noncoding RNAs involved in the sexual reproduction of rice

1. 共获得3.89×108 条reads；经比对分析，得到2224 条lncRNA，包括1624 条lincRNA 和600 条lncNATs 。

2. 水稻的lncRNA 与拟南芥和动物细胞内的lncRNA 有着显着区别，表现出极高的组织特异性和发育阶段特异性，且很多lncRNA 跟水稻的生殖功能相关（图1）。

图1 高表达的lncRNA 与蛋白编码基因在17 个时期/ 组织特异表达

3. 构建了水稻相关lncRNA的插入突变库。通过比对突变体数据库，发现和lncRNA相关的突变体与表型的关联，分为两类，一类和生殖繁殖有关，如不育、异常的圆锥花序等；另一类与植株生长相关，如植株高度、发芽等。

4. 部分lncRNA 为内源性竞争RNA，可削弱细胞内miR160、 miR164 的功能，调节microRNA 靶基因的表达，从而发挥生殖调控作用（图2）。

图2 水稻lncRNA 的功能分析

5、通过将含有T-DNA 插入体的lncRNA 导入水稻，寻找到与花序的发育和生殖能力紧密相关的lncRNA。

Zhang Y C, Liao J Y, Li Z Y, et al. Genome-wide screening and functional analysis identify a large number of long noncoding RNAs involved in the sexual reproduction of rice[J]. Genome Biology, 2014, 15(12): 512.