在上篇文章中,小编为各位分享了基因组学前沿技术应用研讨会的上午会场情况。今天小编将带大家领略下午会场的盛况~
嘉宾报告精彩回顾
中国农业科学院(深圳)基因组研究所的张兴坦研究员以基因组学研究揭示榕树进化之谜为题分享了近期在榕树基因组中所取得的重要研究成果:通过比较基因组、群体遗传学、转录组和代谢组等组学研究,揭示了榕树气生根发育、性别决定的未解之谜,并在基因组水平上揭示了榕树-榕小蜂在形态和生理方面的协同演化对双方类群的协同多样化的重要影响。
作物性状改良的基础是对决定性状形成的遗传基础的解析,其中,决定器官分化的基因时空特异表达的调控元件的分离和调控网络的构建是未来作物改良的基础。此次会议中,华中农业大学的鄢文豪教授以基因转录调控为题,主要围绕调控元件动态图谱和转录因子作用网络的构建展开了详细的介绍。
中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所的徐炜研究员以R-loop测序技术开发与应用为题进行了分享,基于单链 DNA 连接技术,开发了稳定可靠且提供 R-loop 链特异性信息的全基因组 R-loop 检测方法——ssDRIP-seq,为DNA的转录研究提供了很好的研究思路,通过研究发现RNA的m6A 修饰是通过影响R-loop的结构,来调控基因转录的终止过程。
北京大学的周岳研究员以H2AK121ub in Arabidopsis associates with a less accessible chromatin state at transcriptional regulation hotspots为题分享了通过整合不同拟南芥中PcG突变体的染色质可及性、组蛋白标记和表达分析,证实了PcG活性的丧失导致了染色质可及性的增加,但这并不一定伴随着转录激活,表明了可及性染色质并不总是预测基因表达。
南京大学的陈迪俊副教授以ChIP-Hub: an integrative platform for exploring plant regulome为题围绕自主开发的ChIP-Hub调控组学大数据平台展开了详细的阐述,利用ChIP-Hub探索了超过40种植物的8,000多个ChIP-seq相关数据集并进行重新分析和比较,同时指出了利用这一资源将允许来自不同领域的生物学家使用所有可用的调控基因组信息,以获得更多针对其特定问题的新见解。
安诺优达的生物信息中心总监刘涛博士以三代测序技术助力多组学研究进入新时代为题分享了三代测序在各个组学上的应用以及安诺优达在这些应用上的优化。随后通过对Pacbio数据的比对分析,展示了安诺优达在三代多组学数据应用方向进行的数据利用率、检测效果、资源消耗等问题的优化,表明将更好的服务于三代测序多组学研究。
结束了精彩纷呈的报告环节,各位专家学者又针对以下4个主题进行了热烈的圆桌讨论:
1)多倍体与二倍体材料相比在基因组研究中有哪些异同?
2)针对复杂基因组中存在的大量高重复、高杂合区域,是否有新的技术手段或者分析策略可以提升组装质量?
3)期望测序技术未来在基因组学研究中有哪些方面的突破?
4)农业基因组研究领域发展的趋势和方向有哪些?
在本次讨论中,各位专家学者畅所欲言,理性科学的想象让讨论变得极其生动有趣,同时也提出了很多宝贵建议,让人受益匪浅。
至此,在各位专家以及与会嘉宾的大力支持和积极参与下,本次基因组学前沿技术应用研讨会圆满落幕。再次衷心感谢中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究员对于此次会议的襄助。