PacBio Sequel II/IIe平台测序

  • 产品简介
  • 技术流程
  • 样本要求
  • FAQ


三代建库测序是指对合作伙伴提供的合格DNA/RNA样本,运用科学标准的实验方法进行文库构建,或对客户提供的合格文库,运用PacBio Sequel II/IIe平台进行测序,获得高质量的测序数据,以供研究人员开展后续生物信息学分析。


产品优势
  • 测序平台
    11台PacBio Sequel II/IIe,日均通量超2Tb
  • 认证资质
    PacBio官方CSP认证资质,实验建库成功率超98%
  • 交付周期
    纯测序8天起,建库测序11天起
  • 项目经验
    提取建库物种经验500+,分析大项目300+;涵盖林木、农作物、中草药、海洋生物、昆虫、人和其他哺乳动物
PacBio Sequel IIIIe平台测序.png
产品类型送样要求
HiFi模式

总量:≥6.5μg;

浓度:≥80ng/μL;

质量:基因组完整性,DNA主带≥30Kb;

纯度:OD260/280=1.8~2.0,OD260/230=1.6~2.5,NC/QC=0.5~3.0。

ISO-seq

样品类型:RNA样品;

样品需求量:RNA总量≥2μg;

样品浓度:≥230ng/μL;

样品纯度:OD260/280=2.0~2.2,OD260/230=1.6~2.1;

样品完整性:28S:18S≥1.0;RIN≥7.5。

PCR产物

样品类型: 不粘稠、 主带集中、 无 RNA 污染的 PCR 产物;

总量:≥3μg;

浓度:≥50ng/µl;

纯度: OD260/280=1.8~2.0,OD260/230=1.8~2.5, QC/NC=0.5~3.0。

外来文库

三代DNA文库:样品浓度满足≥1*Size(kb)ng/μL,总量≥12*Size(kb)ng,主带集中不拖尾,文库样本无颜色,不粘稠,无杂带;

三代RNA文库:样品浓度满足≥3*Size(kb)ng/μL,总量≥25*Size(kb)ng,文库样本无颜色,不粘稠。


  • Q:三代文库构建流程是什么?
    A:
    质检合格的DNA样本通过以下流程进行文库构建:
    (a)将基因组DNA打断成合适的DNA片段(可选);
    (b)利用磁珠富集纯化后对DNA片段进行损伤修复和末端修复;
    (c)在DNA片段两端连接茎环状测序接头;
    (d)筛选DNA片段,并进行纯化;
    (e)文库绑定测序引物和酶复合物后上机测序。

  • Q:何进行数据交付?
    A:
    默认交付格式为HiFi数据;数据交付时依据合作伙伴需求,提供硬盘或云传输等多种交付形式。