小伙伴们,今天分享一个超有料的话题!安诺育种数据库的功能解读,看看如何让数据开口说话,如何提升数据的处理与调取效率。
小编先介绍一下数据库的优势:1)能存储组学海量数据,尤其适合处理大数据量和多种数据类型的项目;2)聚合多种生物信息学分析工具模块,分析省时省力;3)数据库发表后其他科研工作者可以轻松引用这些数据;4)有效保护数据安全,避免丢失和误删等问题的发生。总之,安诺育种数据库功能多,让大家在育种的道路上更加有底气!快来一起探索吧~
数据库首页展示
功能介绍
01 中英文模式切换
数据库设置中英文切换模式,便于科研工作的交流、paper撰写等。
02 基因组展示
基因组模块包括基因组组装与注释的基本信息,并利用Jbrowse展示组装后的基因组,实现可视化。在“JBrowse”的下拉选项,点击样本名称可看基因组信息,点击每个基因的位置信息,页面会超链到 JBrowse,直观展示该基因在基因组中的可视化结构。
基因组界面
基因组浏览器(JBrowse)
03 数据可视化展示
种质资源模块展示种质材料、性状的表型数据。变异信息模块包括单核苷酸多态SNP、插入缺失InDel、拷贝数变异CNV和结构变异SV这四种变异类型的数据。基因和通路模块在这里都有详细的描述列表,包括基因名/通路ID以及多个数据库注释版本信息。这几个模块点击进入后,里面内容以表格形式直观展示,且表格查询功能超级赞!
1)表格每列均可查询,可筛选数值、数值范围、关键词,可同时筛选多个条件,方便调取数据;
2)每个表格的排布密度可调整为默认、中等、紧凑三种形式;
3)每列可按升/降序排列,方便快捷;
4)表格采用分页展示,每页展示10行数据,提升加载速度!
种质资源与变异信息界面
变异信息界面
表格展示形式
04 工具模块
除数据库展示的几个小工具外,安诺云(https://www.solargenomics.com/#foot)还上线多款小工具,生信小白也可实现“分析自由”。
工具界面与安诺云小工具
数据库提供相关数据与结题报告的下载功能,可随时下载。
大数据浪潮下,数据库在挖掘和利用基因组等组学技术产生的海量数据过程中日渐重要。安诺优达可承接基因组标准数据库、多组学数据库及定制化数据库项目,让你轻松拥有丰富的信息资源和分析工具,助力生物学基础研究。安诺优达具有丰富的数据库开发和搭建经验,如您有数据库相关意向,请联系当地销售,可以根据您的研究目的,为您提供数据库搭建服务~