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SCI助力工具 | 20ng=90Gb HiFi?微小昆虫基因组组装福音
发布时间:2024-07-19

昆虫是地球上最丰富多样的生物类群之一,对生态系统的稳定性和农业生产具有重要影响。研究昆虫基因组,不仅有助于理解它们的进化和生态适应,还能在生物防治、药物开发和环境保护等方面发挥关键作用。安诺优达新型建库产品,专为昆虫三代微量DNA建库测序而设计,即使是ng级别的DNA投入,也能实现高质量的HiFi数据产出。


最新实测数据.png


在输入20ng DNA后,安诺优达微量建库产品最新产出突破单Cell 94 Gb!


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产品特点.png


  • 低起始DNA量:支持ng级别的DNA样本投入,适用于珍稀昆虫或个头微小样本的基因组研究;


  • 有效建库模式:采用安诺优达自主研发的建库技术,确保有效、准确地构建HiFi文库;


  • 优质测序质量:通过优化的测序流程,确保高精度的HiFi数据产出。


投入量对比.png


传统三代文库构建DNA需求量在3μg左右,微量建库DNA仅需20ng即可完成建库。


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建库投入量


成功案例.png


截至目前,安诺优达已经完成若干昆虫微量建库测序项目,并进行昆虫基因组组装,结果显示,使用安诺优达自研昆虫微量建库产品,组装Contig N50可超1 Mb,Busco评估大于97%。


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适用范围.png


  • 微小昆虫个体


个头直径2-5mm大小的昆虫个体,例如:寄生蜂、果蝇、蓟马等小微昆虫。


  • 培养难度高、混合测序样本搜集困难


虽然可以通过混合多头样本的方法进行测序,但是部分昆虫样本培养困难,大批量搜集样本存在实验瓶颈,单头个体提取后微量建库可以有效解决这一问题。


  • 样本杂合度高,混合测序后基因组组装大小严重高于预估


昆虫基因组结构本身较为复杂,有时虽然采用了多头混合提取建库的方法进行三代测序并组装,但经常会伴随基因组组装结果异常,远大于预估大小,且无法通过生信手段调整的情况,采用单头昆虫进行微量建库,能够打破这一技术限制。