NextSeq 550AR平台测序

  • 产品简介


NextSeq 550AR(国械注准20173220330)测序服务



建库测序12天,纯测序包FC 5天


送样标准

         文库类型         片段大小质量标准体积(μl)QPCR 浓度(nM/L)

质量浓度

(ng/μl)

Qubit 检测

体积(μl)
平均插入片段100 bp 文库

1. 引物二聚体浓度<3%

2. 客户提供片段大小偏差<10%

3. 插入片段小于600bp

>10>7>1.01.5mL离心管
平均插入片段200 bp 文库>10>10>1.8
平均插入片段300 bp 文库>10>10>2.5
平均插入片段400 bp 文库>10>10>3.2
平均插入片段500 bp 文库>10>10>4.0

注:
Qubit 检测浓度要求与文库插入片段直接相关,上机定量以 QPCR 浓度为准;

若文库引物二聚体比例>5%或文库片段大小偏差>10%则需要项目管理与客户沟通,风险上机客户需承担相应风险;

NextSeq 550AR平台(国械注准20173220330)要求包FC测序。

平台参数
类别数据量数据质量
SE50包FC(330-400 M raw reads)Q30≥90%
SE75包FC(330-400 M raw reads)Q30≥83%
PE50包FC(中通量130 M raw reads,高通量400 M raw reads)Q30≥80%
PE150包FC(400 M raw reads)Q30≥80%