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三代宏基因组

产品简介
技术流程
样本要求
FAQ

三代宏基因组测序是指利用PacBio第三代单分子实时测序技术以特定环境下微生物群体基因组为研究对象，组装出核心菌群的基因组，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。与二代测序方法相比，三代宏基因组采用PacBio SMRT测序的长读长可以减少部分组装错误，有效提高微生物群落鉴定的分辨率。

产品优势

组装效果
提高样本中物种基因的完整度
提高注释的准确度和分辨率
注释到更多的低丰度物种
深层次的功能挖掘
如抗性基因、基因簇和病毒信息等

应用领域

微生态领域
动物营养免疫及治疗领域
土壤、活性淤泥、废水等环境领域
根际微生态等植物领域

14、三代宏基因组测序.png

产品类型	测序策略	推荐数据量	周期
三代宏基因组测序	10kb HiFi DNA文库	≥50G	50天

	送样要求
样本送样量	粪便（3-5g），土壤（≥10g）
DNA总量	≥5μg
DNA浓度	≥80ng/μg
DNA纯度	OD260/280在1.8-2.0， OD260/230在1.6-2.5， NC/QC在0.5-3.0
其他要求	无RNA污染，DNA样本无颜色，主带集中无降解，不粘稠，无杂带

Q: 三代宏基因组测序相比二代宏基因组的优势是什么？
A：
三代宏基因组的研究用于实现更准确的微生物物种分类以及更加详细的功能基因组注释，解决目前二代技术鉴定种群较少、优势菌种基因组组装质量较差、核心基因组分功能信息分析不全等缺点。
Q: 三代宏基因组测序目前可以接的样本类型有哪些？
A：
目前可以接的样本类型有粪便（3-5g）和土壤（≥10 g）两种类型，其他样本类型在实验测试和研发中，后续会及时进行更新，请关注官网或官方微信公众号信息。
Q: 三代宏基因组的测序数据量推荐是多少？
A：
我们推荐三代宏基因组构建10k的HiFi DNA文库，测序数据量最低为50G，以保证序列拼接和物种鉴定的准确性。如客户有需要鉴定出更详细的低丰度物种，可适当加大测序数据量。