单细胞测序技术在生命科学和生物医学领域的应用不断拓展，并在解析细胞异质性、揭示微环境中细胞群体间的关系以及追踪疾病发生发展等方面发挥着越来越重要的作用，从而帮助研究者在疾病诊断和分层过程中寻找更好的生物标志物，并为个性化预防和治疗提供技术支持。下面小编带来2篇医学疾病领域发表的单细胞合作文章导读，希望为大家相关研究带来启发。
文章1
文章标题：Dynamic atlas of immune cells reveals multiple functional features of macrophages associated with progression of pulmonary fibrosis
发表期刊：Frontiers in Immunology（IF=7.3）
发表时间：2023.9
作者单位：清华大学
文章链接：https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1230266
安诺提供的服务：10X 单细胞建库、测序和分析
特发性肺纤维化（IPF）是一种病因不明、病程短暂且死亡率高的慢性间质性肺病，患者以老年人为主，发病率和患病率逐年上升。由于IPF疾病的不可逆性和目前缺乏有效治疗药物，患者的生活质量和心理状态受到了进一步的限制。免疫细胞，特别是巨噬细胞在IPF进展过程中被认为扮演着重要角色，但其在不同病程阶段的表征变化和功能特性尚未得到明确的解释。因此，深入了解巨噬细胞在IPF进展过程中的状态和功能改变的精细调控，将有助于发现并开发针对IPF的新疗法靶点。
01 实验设计
02 实验结果
① 建立了小鼠肺纤维化的模型，构建了单细胞图谱，并分析了四个不同阶段（Day 0、7、14和21）的肺脏免疫细胞的动态单细胞景观。
② 通过比较和分析免疫细胞间的相互作用，发现巨噬细胞在肺纤维化进展过程中发挥着核心的调控作用。
③ 肺泡巨噬细胞和单核细胞衍生的巨噬细胞（mo-Mac）在疾病进展过程中表现出高度的异质性和促纤维化基因表达的动态变化。
④ 进一步确定了与疾病状态相关的细胞簇，并发现Gpnmb和Trem2的基因水平随着纤维化进展而上调，提示其可能在肺纤维化中发挥重要调控作用。
⑤ 对比人类IPF的单细胞测序数据，发现小鼠模型中的巨噬细胞与IPF患者中的巨噬细胞在基因表达和代谢状态方面具有共性，为研究巨噬细胞的病理特征提供了新的见解，有助于研究巨噬细胞病理特征和寻找IPF治疗新靶点。
文章2
文章标题：Single-cell RNA sequencing analysis reveals that N-acetylcysteine partially reverses hepatic immune dysfunction in biliary atresia
发表期刊：JHEP Reports（IF=8.3）
发表时间：2023.9
作者单位：广州市妇女儿童医疗中心
文章链接：https://doi.org/10.1016/j.jhepr.2023.100908
安诺提供的服务：10X 单细胞建库、测序
胆道闭锁（BA）是一种对新生儿肝脏造成严重影响的疾病，目前尚无有效药物治疗。N-乙酰半胱氨酸（NAC）是一种半胱氨酸前体，已被用于减轻对乙酰氨基酚过量引起的肝损伤程度，以及治疗非乙酰氨基酚诱导的儿童急性肝衰竭。研究表明，它还可促进婴儿BA的免疫恢复。研究显示，线粒体呼吸链（OXPHOS）和活性氧（ROS）在胆管上皮细胞（BEC）损伤中起着关键作用。而NAC治疗可通过降低OXPHOS和ROS水平，显著改善病情。然而，目前尚未从单细胞分辨率层面解析NAC治疗如何改变BA患儿肝脏免疫调节机制。
01 实验设计
02 实验结果
① 静脉注射NAC治疗通过改善胆红素代谢和胆汁酸流量，对患有BA的婴儿显示出有益的疗效。
② 通过单细胞测序分析，鉴定了先天细胞的两个肝脏中性粒细胞亚群，发现NAC处理可抑制未成熟中性粒细胞的氧化磷酸化（OXPHOS）和活性氧（ROS）产生。
③ NAC减轻了BA中单核细胞介导的炎症反应并逆转了肝巨噬细胞功能障碍。
④ NAC通过细胞-细胞相互作用下调了BA中的先天/适应性促炎反应。
