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年度盘点|单细胞和空间组学文章概览
发布时间:2024-01-04

2023,科研圈有许多突破性成果发表,安诺优达见证了每一位合作伙伴的拼搏奋进。2023,安诺优达与客户合作发表文章70+,累计影响因子1200+。2024,安诺优达将继续为每一位合作伙伴提供优质的科研服务。今天,单细胞和空间组学年终总结来啦,小编精心挑选了合作发表的部分文章,向大家展示单细胞和空间组学技术如何在各个研究领域“大展拳脚”。


单细胞和时空转录组解码人脑多区域时空发育奥秘


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发表期刊:Cell(IF=64.5)

发表时间:2023年12月

研究领域:神经科学

安诺提供服务:10x Genomics单细胞转录组测序,Stereo-seq时空转录组实验、建库、测序、基础分析等服务该研究将单细胞转录组测序和时空转录组技术相结合,首次解析迄今为止跨时间点最广(GW6-GW23)、面积最大(最大4cm x 3cm)的人脑多区域时空发育转录组图谱。该研究鉴定并呈现了发育早期具有特定空间分布特点的异质性放射状胶质细胞亚型,揭示这些异质性放射状胶质细胞有助于随后不同脑区神经元的特化,同时发现胶质细胞和神经元互作也会促进神经元的区域特化。


食蟹猴胚胎体外3D模型解析早期器官发生


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发表期刊:Cell(IF=64.5)

发表时间:2023年5月

研究方向:发育生物学

安诺提供服务:10x Genomics单细胞转录组建库测序服务该研究开发了一种嵌入式3D培养系统,可以在受精后的25天内延长食蟹猴胚胎的体外培养时间。结合形态学、组织学和单细胞转录组测序分析,系统地解析了原肠胚运动及造血等早期组织器官发生的谱系特化轨迹和分子演进规律。


3D人类胚胎和胚胎样组合体破译着床期发育机制


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发表期刊:Cell Research(IF=44.1)

发表时间:2023年7月

研究方向:发育生物学

安诺提供服务:转录组建库测序、甲基化建库测序和10x Genomics单细胞建库测序服务该研究构建了能高度模拟人围着床发育的3D胚胎模型,通过单细胞转录组测序绘制了人围着床胚胎的完整细胞图谱。再现了人围着床胚胎的发育特征、三维结构(双胚盘、羊膜腔和卵黄囊)和细胞谱系(胚外内/中胚层、原始生殖细胞和原条)。该研究系统揭示了人围着床胚胎的发育动态、谱系特征、基因信号以及关键信号通路在不同谱系命运决定过程中的功能,为进一步探索人胚胎着床后的谱系特化、信号互作和组织模式提供了一个新模型,同时也为胚胎异常发育进行药物研发和毒理测试提供了一个新平台。


利用气液界面培养方法体外构建具有腔上皮的人类子宫内膜类器官模型


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发表期刊:Advanced Science(IF=15)

发表时间:2023年8月

研究方向:类器官图谱

安诺提供服务:10x Genomics单细胞建库测序和转录组建库测序服务该研究构建了一个新的子宫内膜类器官(ALI-EnAo),其具有完整的腔上皮和腺上皮结构。通过免疫荧光、单细胞图谱等分析,揭示了ALI-EnAo能够再现子宫内膜的特征,包括解剖结构、细胞组成、激素诱导的月经周期性变化和基因表达谱。此外,ALI-EnAo还复制了着床窗和动态纤毛形成的基因表达模式,这对胚胎植入是至关重要的。该模型为深入研究胚胎植入、子宫内膜疾病和再生机制提供了一个新平台。


单细胞测序揭示卵巢癌新型耗竭T细胞标志物


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发表期刊:Clinical and Translational Medicine(IF=10.6)

发表时间:2023年9月

研究方向:癌症研究

安诺提供服务:10x Genomics单细胞建库测序和合作分析服务该研究对卵巢癌及正常卵巢进行单细胞转录组测序,探索了卵巢癌中T细胞的耗竭情况,深入挖掘了能预测T细胞耗竭的新型标志物及其相关机理。研究团队绘制了正常卵巢、交界性卵巢癌及高级浆液性卵巢癌的单细胞图谱,揭示了各种组织类型中T细胞的数量及特征,通过比较CD8+耗竭T细胞和CD8+效应T细胞的转录组谱系,进一步筛选出与T细胞耗竭密切相关的基因TNFRSF1B,体内外实验均证明了TNFRSF1B通过抑制IFN-γ表达促进肿瘤的进展。


单细胞RNA测序分析揭示N-乙酰半胱氨酸在肝脏免疫障碍中的作用


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发表期刊:JHEP Reports(IF=8.3)

发表时间:2023年9月

研究方向:疾病免疫

安诺提供服务:10x Genomics单细胞建库测序服务该研究发现静脉注射N-乙酰半胱氨酸(NAC)治疗可改善胆红素代谢和胆汁酸流量,对患有胆道闭锁(BA)的婴儿显示出有益的疗效。通过单细胞测序分析,鉴定了先天细胞的两个肝脏中性粒细胞亚群,发现NAC处理可抑制未成熟中性粒细胞的氧化磷酸化(OXPHOS)和活性氧(ROS)产生。NAC减轻了BA中单核细胞介导的炎症反应并逆转了肝巨噬细胞功能障碍。NAC通过细胞-细胞相互作用下调了BA中的先天/适应性促炎反应。


柑橘胞质杂种雄性不育核质互作调控网络的研究


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发表期刊:Horticulture Research(IF=7.29)

发表时间:2023年5月

研究方向:发育生物学

安诺提供服务:Smart-seq2单细胞转录组测序该研究通过细胞工程培育了雄性不育且果实无核柑橘新品种‘华柚2号’、‘华柚3号’。根据形态学观察,确定亲本HB柚和胞质杂种‘华柚2号’雄蕊起始及发育关键时期。利用激光显微切割精细取样雄蕊发育5个时期特异组织和细胞,结合单细胞转录组发掘柑橘雄蕊特异组织细胞的基因时空表达特征。