10x Genomics单细胞转录组测序

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  • 技术流程
  • 样本要求
  • FAQ


10x Genomics是基于微流控技术的单细胞文库制备系统,可以同时获得1,000-80,000以上的单细胞,通过测序实现对高通量单细胞数据进行细胞群体的分类以及细胞群体间基因表达的差异分析。10x Genomics单细胞表达分析可应用的细胞类型众多,如肿瘤细胞、免疫细胞、干细胞、神经细胞、生殖细胞、胚胎细胞等,是研究肿瘤异质性,免疫细胞群体和胚胎发育的优质方法。


应用领域
  • 癌症研究
  • 胚胎发育研究
  • 细胞异质性研究
  • 细胞分化研究
  • 免疫研究
样品要求
细胞分离 由合作方或安诺完成单细胞悬浮液的制备
样品类型 活体新鲜完整细胞的细胞悬浮液;冻存的细胞悬浮液;不适于经固定、染色等处理的样本
样品总量 总量>6*105个,同一个细胞平行准备2份(1份质检,1份实验)
样品浓度 700-1200个/μl
样品质量 细胞不能成团,少碎片,活性>85%,细胞直径<30μm,不存在逆转录抑制剂及非细胞的核酸分子
细胞冻存液保存 分装保存于冻存液中,细胞冻存液:DMEM+20%FBS+10%DMSO
冻存液细胞浓度 100万个细胞/ml,每1ml分装至1个冻存管
  • Q:10x Genomics单细胞转录组测序分析原理
    A:
    10x Genomics平台能够在7分钟内完成多至80,000个细胞的自动分选,每个油滴包裹凝胶珠(GEM)中含有单个细胞和逆转录反应体系。基因表达定量与细胞群体分类主要利用cell Barcode和UMI信息对单细胞中基因表达量进行分析,并根据表达量对单细胞群体进行划分,寻找群体间差异表达基因。